DNBSEQ-T1+
Điều gì khiến T1+ trở thành máy giải trình tự hàng đầu cho các ứng dụng có thông lượng cao?
T1+ là một trong những máy giải trình tự gen có thông lượng trung bình đến cao nhanh nhất thế giới, tạo ra dữ liệu giải trình tự PE150 chỉ trong vòng 24 giờ (600Gb cho một flowcell và 1,2Tb cho hai flowcell chạy song song) với chất lượng vượt trội (Q40 > 90%). Máy có ba loại flowcell (FCS, FCM và FCL), mang lại sự linh hoạt để vận hành một hoặc hai flowcell độc lập hoặc đồng thời, với thông lượng từ 25-1200Gb để xử lý các dự án giải trình tự phức tạp đòi hỏi tốc độ và độ chính xác cao.
T1+ có những cấu hình và mẫu mã nào?
T1+ có hai phiên bản khác nhau: RUO (Chỉ dành cho nghiên cứu) ra mắt toàn cầu vào quý 1 năm 2025, và IVD (Chẩn đoán trong ống nghiệm). Đối với phiên bản RUO, khách hàng có thể chọn T1+RS (không có mô-đun tin sinh học, tạo fastQ tiêu chuẩn) hoặc T1+ARS (bao gồm mô-đun tin sinh học tích hợp để phân tích thứ cấp tự động với quy trình làm việc của MGI cho WGS và WES).
Mô-đun DNB Make & Load tích hợp giúp nâng cao hiệu quả quy trình làm việc như thế nào?
Máy T1+ tích hợp mô-đun DNB M&L cho phép chuẩn bị DNB hoàn toàn tự động và nạp mẫu động ngay trong máy. Bộ thuốc thử được thiết kế sẵn cho phép thêm chất lỏng chỉ bằng một cú nhấp chuột mà không cần thao tác thủ công lặp đi lặp lại. Sau quá trình thử nghiệm rộng rãi, mô-đun DNB M&L đạt được độ ổn định cao (>95%) trong việc tạo ra DNB, loại bỏ nhu cầu về quy trình kiểm soát chất lượng DNB trong khi vẫn giữ lại DNB để khắc phục sự cố sau này.
Thông số kỹ thuật và khả năng hoạt động của buồng đo lưu lượng là gì?
Hệ thống T1+ hỗ trợ ba loại flowcell với thông lượng khác nhau: FCS (500 triệu lượt đọc hiệu quả, 2 làn, đầu ra tối đa 300G PE150), FCM (1000 triệu lượt đọc hiệu quả, 2 làn, đầu ra tối đa 600G) và FCL (2000 triệu lượt đọc hiệu quả, 4 làn, đầu ra tối đa 1200G). Thời gian chạy thay đổi tùy theo cấu hình: FCS PE150 mất 19 giờ, FCM PE150 mất 19,5 giờ và FCL PE150 mất 24 giờ. Hệ thống sử dụng chip mật độ cao 500nm với bước pitch 500nm cho đầu ra dữ liệu vượt trội.
T1+ xử lý các thư viện của bên thứ ba và vấn đề tương thích như thế nào?
Hiện tại, T1+ khuyến nghị sử dụng đầu vào ssCirDNA hoặc DNB. Đối với thư viện dsDNA ILMN không phosphoryl hóa 5′, cần thực hiện chuyển đổi thủ công bằng Bộ chuyển đổi thư viện đa năng MGIEasy (App-A) cùng với bộ kit giải trình tự T1+App-D. Bộ kit App-D chứa các mồi adapter Illumina TruSeq, Nextera và MGI hỗ trợ phát hiện hỗn hợp. Bản nâng cấp H2 2025 sẽ bổ sung thuốc thử OS một bước và enzyme T4 PNK để tương thích trực tiếp với đầu vào dsDNA.
Khả năng lưu trữ và phân tích dữ liệu là gì?
Phiên bản T1+RS có dung lượng ổ cứng 20TB, lưu trữ khoảng 8 lần chạy (PE150), hoặc 12 lần chạy khi bật Q40. Phiên bản T1+ARS có dung lượng 40TB. Hệ thống hỗ trợ WFQ ngoại tuyến thông qua giao diện người dùng và khả năng WFQ bên ngoài. Chức năng tải lên tự động cung cấp tải lên rsync và chế độ cục bộ thông qua các thư mục chia sẻ qua phương thức samba và nfs. Đầu ra mặc định là dữ liệu Q30, Q40 có sẵn theo yêu cầu thông qua kích hoạt FSE.
T1+ hỗ trợ tối ưu những ứng dụng và chiến lược giải trình tự nào?
T1+ lý tưởng cho giải trình tự methyl hóa, giải trình tự khối u, giải trình tự toàn bộ hệ gen (WGS), giải trình tự toàn bộ exome (WES) và giải trình tự toàn bộ hệ gen bằng phương pháp bisulfite (WGBS). Hệ thống xử lý hiệu quả các mẫu có kích thước trung bình (10-50 mẫu khối u mỗi lần chạy) với thời gian xử lý nhanh. Hệ thống hỗ trợ nhiều độ dài đọc khác nhau: SE50, SE100, PE150 và PE300, với thông lượng methyl hóa dự kiến đạt 500 triệu/làn sau khi nâng cấp lên ECR1.0 vào tháng 11.
T1+ quản lý việc xử lý và bảo trì hóa chất thử như thế nào?
Hệ thống này yêu cầu các vật tư tiêu hao chuyên dụng, bao gồm dung dịch NaClO (Sigma 239305) dùng cho dung dịch rửa, và có thể bổ sung thêm các sản phẩm thay thế nhãn hiệu Aladdin. Thiết bị cần 8 ống PCR 0,2mL (AXYGEN PCR-0208-CP-C) để chứa hỗn hợp phản ứng DNB, với 125 ống được cung cấp kèm theo khi mua thiết bị. Bốn hộp chứa dung dịch rửa rỗng (PN: 940-002757-00) được cung cấp để khách hàng tự pha chế dung dịch làm sạch.
Các yêu cầu về cơ sở hạ tầng và thiết lập cho T1+ là gì?
T1+ yêu cầu bàn đỡ chịu được trọng lượng trên 450kg (có sẵn mã sản phẩm: 960-002351-00). Hệ thống hiện tại không hỗ trợ đọc mã vạch trước (BBS) do hạn chế về thuốc thử sinh hóa, nhưng chức năng BBS sẽ được phát triển trong các bản nâng cấp thuốc thử trong tương lai. Các làn khác nhau trên cùng một buồng dòng chảy không thể bơm các thuốc thử khác nhau – chỉ có thể nạp các thư viện hoặc DNB khác nhau cho mỗi làn.
T1+ xử lý các hoạt động đồng thời và các hạn chế về quy trình làm việc như thế nào?
Hệ thống T1+ARS không thể thực hiện phân tích tin sinh học trong khi giải trình tự – một khi quá trình giải trình tự bắt đầu ở bất kỳ phía nào (A hoặc B), phân tích tin sinh học không thể bắt đầu và ngược lại. Để phân tích đồng thời trong quá trình giải trình tự, cần xem xét sử dụng các công cụ tin sinh học bên ngoài như PFI. Hệ thống hỗ trợ các yêu cầu cân bằng mã vạch và cung cấp khả năng trực quan hóa quy trình cao với các video hướng dẫn tích hợp sẵn để loại bỏ các vấn đề vận hành.
MÁY GIẢI TRÌNH TỰ DNBSEQ-T1+
DNBSEQ-T1+ là hệ thống giải trình tự thế hệ mới dựa trên công nghệ DNBSEQ™, mang lại hiệu suất tầm trung nhưng khả năng xử lý dữ liệu mạnh mẽ. Hệ thống có thể tạo ra 25 Gb – 1.2 Tb dữ liệu trong vòng dưới 24 giờ với độ chính xác Q40, giúp các phòng thí nghiệm nhanh chóng thu được dữ liệu genome chất lượng cao.
Được thiết kế như một hệ thống giải trình tự “all-in-one”, DNBSEQ-T1+ tối ưu hóa toàn bộ quy trình từ chuẩn bị mẫu đến phân tích dữ liệu, giúp các nhà khoa học dễ dàng thực hiện nghiên cứu genomics từ giai đoạn khám phá, xác thực cho tới sản xuất quy mô lớn với chi phí hiệu quả.
Thông tin sản phẩm
DNBSEQ-T1+ là hệ thống giải trình tự thế hệ mới được phát triển dựa trên công nghệ DNBSEQ™, mang đến hiệu suất mạnh mẽ cùng độ chính xác cao cho các phòng thí nghiệm nghiên cứu genomics.
Thiết bị được thiết kế để tối ưu hóa toàn bộ quy trình giải trình tự DNA từ chuẩn bị thư viện, tạo DNB đến nạp flow cell và chạy sequencing. Nhờ công nghệ DNB Make & Load tích hợp trực tiếp trong hệ thống, quá trình chuẩn bị và nạp mẫu được tự động hóa, giúp giảm thao tác thủ công và nâng cao hiệu quả vận hành.
DNBSEQ-T1+ thuộc nhóm máy giải trình tự tầm trung (mid-throughput sequencer) nhưng có khả năng xử lý dữ liệu lớn trong thời gian ngắn. Hệ thống có thể tạo ra từ 25 Gb đến 1.2 Tb dữ liệu trong vòng chưa đến 24 giờ, đồng thời đạt độ chính xác Q40, giúp đảm bảo chất lượng dữ liệu giải trình tự đáng tin cậy.
Thiết bị phù hợp cho nhiều ứng dụng nghiên cứu sinh học phân tử và y sinh học, từ nghiên cứu cơ bản đến các dự án giải trình tự quy mô lớn.
Thông số hoạt động
| Thông số | Giá trị |
|---|---|
| Số lượng Flow Cell / lần chạy | 1 – 2 |
| Loại Flow Cell | FCS, FCM, FCL |
| Số lượng Reads hiệu quả / Flow Cell | 500 – 2000 triệu reads |
| Định dạng Reagent | PE300, PE150, SE50 |
| Dữ liệu đầu ra / Flow Cell | ~200 Gb |
| Chất lượng Q30 | SE50/100 > 93%, PE300 > 85% |
| Thời gian chạy | 4.5 – 35 giờ |
| Kích thước thiết bị | Thiết kế để bàn nhỏ gọn (Compact bench-top) |
| Tính năng nổi bật | Flow cell linh hoạt cho nhiều loại thí nghiệm |
Công nghệ DNB độc quyền
Bằng cách sử dụng công nghệ DNA Nanoballs (DNB) và phương pháp khuếch đại tuyến tính đặc biệt, thiết bị thực hiện khuếch đại tốc độ cao một cách hiệu quả, đồng thời đảm bảo giảm tỷ lệ lỗi.
Hơn nữa, thiết kế các vị trí hoạt hóa trên Flow cell (nanochip) theo mô hình Array cho phép tăng cường tín hiệu trong khi đảm bảo độ chính xác giải trình tự mà không gây nhiễu tín hiệu. Thiết bị sử dụng công nghệ Tổng hợp tổ hợp đầu dò-mỏ neo (cPAS) được cải tiến để kết hợp một đầu dò huỳnh quang với một mỏ neo DNA trên DNB. Sau đó, một hệ thống hình ảnh có độ phân giải cao được sử dụng để thu thập, đọc và xác định các tín hiệu quang học.
Hệ thống giải trình tự này không chỉ tránh được việc lặp tần suất cao các lỗi trong quá trình đọc bazơ đơn gây ra bởi các sai số tín hiệu vật lý phổ biến, mà nó còn tạo ra thông tin giải trình tự mẫu có chất lượng và độ chính xác cao.
